Non. La technologie Intel VT n'est utile que pour les programmes qui sont compatibles avec elle, et l'utilisent effectivement. AFAIK, les seuls outils utiles qui peuvent le faire sont les sandboxes et les machines virtuelles. Même dans ce cas, l'activation de cette technologie peut être un risque de sécurité dans certains cas. Souvent, la technologie de virtualisation n'est pas nécessaire pour émuler les instructions x86 ou x86-64, même si cela se fait au détriment de la vitesse.
Comme meilleure pratique, je la laisserais explicitement désactivée, sauf en cas de nécessité.